Blender でモデリングしていると、ナイフツールで頂点が重複してできることがある。例えば下の画像で矢印が指している4つの点。1つ動かすと、その下にもう1つ点があるのが分かる。

この重複頂点が邪魔なので調べたところ、マニュアルにも書いてあった - Knife Tool
マニュアル曰く、Clip Start/End(近景/遠景クリップ)の値が極端すぎると重複頂点が発生することがあるらしい。Clip Start を少し大きくすると良い。
確かに以前、近景クリップを最小まで下げたことがあった。
今回はそこまで攻めず、Blender のデフォルトは 0.1m だけど 0.05m にした。必要なら後で少しずつ下げる。
変更後に軽く試した限り、今のところ問題は出ていない。